Родился в 1895 году в деревне Старые Тойси ныне Батыревского района Чувашии в семье крестьянина.
В 1931 году вступил во вновь организованный колхоз «Гвардеец» и вскоре возглавил полеводческую бригаду, а с 1938 года – заместителем председателя колхоза.
Участник Великой Отечественной войны.
В 1943 году был комиссован по состоянию здоровья и вернулся к мирному труду, возглавил шестую полеводческую бригаду по выращиванию зерновых культур.
По итогам работы в 1947 году бригадой И.Е.Перепёлкина был получен урожай пшеницы 31,9 центнеров с гектара на площади 21,5 гектара.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 19 марта 1948 года за получение высоких урожаев пшеницы и ржи в 1947 году бригадир Перепёлкин Илларион Евдокимович удостоен звания Героя Социалистического Труда с вручением ордена Ленина и золотой медали «Серп и Молот».
Проживал в родной деревне Старые Тойси, скончался в ноябре 1969 года.